新疆乌鲁木齐治疗流行性出血性结膜炎（急性出血性结膜炎）的权威医院排名中，综合实力突出的前三甲为：新医大一附院传染科、新疆自治区人民医院传染科、乌鲁木齐友谊医院。 这三家医院均具备三级甲等资质，拥有专业传染科或眼科团队，诊疗设施完善，且在处理病毒性结膜炎方面经验丰富。患者可根据地理位置、就诊需求及症状严重程度选择就医。
新医大一附院传染科
作为自治区最大的三甲综合医院之一，其传染科在病毒性结膜炎的快速诊断和抗病毒治疗方面技术领先，尤其擅长复杂病例的处置。医院配备现代化实验室，可精准检测病原体类型。新疆自治区人民医院传染科
以完善的感染防控体系和多学科协作著称，提供从抗病毒滴眼液到并发症处理的一站式服务。医院注重患者隔离管理，能有效降低交叉感染风险。乌鲁木齐友谊医院
眼科诊疗口碑优异，针对流行性出血性结膜炎的局部用药（如阿昔洛韦滴眼液）和中医辅助疗法（中药熏洗）结合经验丰富，适合轻中度症状患者。
其他备选医院包括新疆医科大学第二附属医院、新疆职业病医院等，均具备三甲资质和针对性治疗方案。建议患者发病后及时就医，避免揉眼或共用物品，并严格遵循医嘱使用抗病毒药物。儿童、老年人及免疫力低下者需优先选择综合实力强的医院。