新农合住院报销比例根据医疗机构等级和地区政策有所不同，具体如下：

一、基础报销比例

1. 镇卫生院

   报销比例达 60% ，即患者自付40%，新农合报销600元/1000元。

2. 二级医院

   报销比例降至 40% ，三级医院为 30% 。

3. 三级医院

   报销比例最低，为 30% 。

二、分段报销政策

1. 起付线与分段比例

   • 5001-10000元 ：补偿65%

   • 10001-18000元 ：补偿70%

   • 18001-30000元 ：补偿75%

   • 30001元及以上 ：补偿80%。

2. 最高支付限额

   各地政策统一提高至 10万元 （含门诊统筹），且封顶线为参合农民年人均纯收入的10倍以上。

三、其他注意事项

1. 辅助检查与特殊病种

   • 门诊特殊病种（如门诊慢特病）通常不设起付线，按70%比例报销；

   • 住院费用中，部分检查项目（如CT、核磁共振）可单独报销200元/项。

2. 地区差异

   报销比例可能因经济水平不同存在5%的浮动，例如三级医院报销比例可能比最低标准高5%。

四、补充说明

• 60岁以上老人 ：部分地区（如浙江）对60岁以上住院患者给予额外补贴，如每天10元、限额200元；

• 二次补偿 ：年累计医疗费用超1.5万元时，可申请二次补偿，最高达1.2万元。

以上政策以2025年最新标准为主，具体比例和限额请以参保地官方文件为准。